二者區(qū)別是三方協(xié)議書是明確畢業(yè)生、用人單位、學校三方在畢業(yè)生就業(yè)工作中的權利和義務的書面表現(xiàn)形式，就業(yè)協(xié)議書是普通高等學校畢業(yè)生和用人單位在正式確立勞動人事關系前，經(jīng)雙向選擇，在規(guī)定期限內(nèi)確立就業(yè)關系、明確雙方權利和義務而達成的書面協(xié)議。

三方協(xié)議書是《普通高等學校畢業(yè)生、畢業(yè)研究生就業(yè)協(xié)議書》的簡稱，它是明確畢業(yè)生、用人單位、學校三方在畢業(yè)生就業(yè)工作中的權利和義務的書面表現(xiàn)形式，能解決應屆畢業(yè)生戶籍、檔案、保險、公積金等一系列相關問題。協(xié)議在畢業(yè)生到單位報到（憑《全國普通高等學校本?？飘厴I(yè)生就業(yè)報到證》或《全國畢業(yè)生研究生報到證》）、用人單位正式接收后自行終止。

就業(yè)協(xié)議書《全國普通高等學校畢業(yè)生就業(yè)協(xié)議書》的簡稱，是普通高等學校畢業(yè)生和用人單位在正式確立勞動人事關系前，經(jīng)雙向選擇，在規(guī)定期限內(nèi)確立就業(yè)關系、明確雙方權利和義務而達成的書面協(xié)議，是用人單位確認畢業(yè)生相關信息真實可靠以及接收畢業(yè)生的重要憑據(jù)，也是高校進行畢業(yè)生就業(yè)管理、編制就業(yè)方案以及畢業(yè)生辦理就業(yè)落戶手續(xù)等有關事項的重要依據(jù)。